（1）出資人不同。個人獨資企業的出資人只能是一個自然人；個體工商戶既可以由一個自然人出資設立，也可以由家庭共同出資設立。

（2）承擔責任的財產范圍不同。個人獨資企業的出資人在一般情況下僅以其個人財產對企業債務承擔無限責任，只是在企業設立登記時明確以家庭共有財產作為個人出資的才依法以家庭共有財產對企業債務承擔無限責任；而根據民法通則第29條的規定，個體工商戶的債務如屬個人經營的，以個人財產承擔，家庭經營的，則以家庭財產承擔。

（3）適用的法律不同。個人獨資企業依照《個人獨資企業法》設立，個體工商戶依照《民法通則》、《城鄉個體工商戶管理暫行條例》的規定設立。

（4）法律地位不同。個人獨資企業是經營實體，是一種企業組織形態；個體工商戶則不采用企業形式。區分二者的關鍵在于是否進行了獨資企業登記，并領取獨資企業營業執照。